Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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