Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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