Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms