Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
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