Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245060.2-201ENST00000412149 524 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 U2AF1L4-203ENST00000412391 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP9-201ENST00000417250 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012074.1-202ENST00000431557 419 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000350.1-201ENST00000443377 532 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099796.2-201ENST00000444140 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BX571846.1-201ENST00000447347 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHJ1P-201ENST00000450690 55 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL728P-201ENST00000464718 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL164P-201ENST00000482613 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2-24-201ENST00000484817 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL454P-201ENST00000492744 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP3-205ENST00000513878 3810 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL606534.5-201ENST00000517560 1243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009901.2-201ENST00000521595 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01485-204ENST00000522731 614 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109635.1-201ENST00000529200 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025578.1-201ENST00000552027 543 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP23P1-202ENST00000567025 423 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL336P-201ENST00000580171 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL615P-201ENST00000584065 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005746.1-202ENST00000585495 716 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067969.2-201ENST00000597015 570 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008750.4-201ENST00000600974 219 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CIDEC-208ENST00000618572 1226 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD274-201ENST00000381573 3343 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VASH2-206ENST00000366968 4224 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms