Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SSPNQ14714 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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