Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00346-201ENST00000538077 6265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM1-201ENST00000333756 3795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBBP1-201ENST00000248151 1335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PLSCR4-201ENST00000354952 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMA4-205ENST00000389463 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR194-2-201ENST00000384864 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHV1-69-201ENST00000390633 412 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX11L5-201ENST00000421620 654 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL929410.1-201ENST00000428250 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357936.1-201ENST00000434375 662 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL55-223ENST00000459783 694 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106872.7-201ENST00000508621 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097376.1-202ENST00000512815 657 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BIN3-207ENST00000520292 775 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MS4A15-204ENST00000528170 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003064.2-201ENST00000528983 510 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093249.2-201ENST00000563540 482 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms