Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4BQ13620 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms