Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 TRIM37-214ENST00000625984 204 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
MKRN4PQ13434 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms