Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms