Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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GPS1Q13098 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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