Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LMAN2Q12907 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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