Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSC4Q9Y5U2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms