Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
USP16Q9Y5T5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP16Q9Y5T5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms