Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PHLDA3Q9Y5J5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PHLDA3Q9Y5J5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms