Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2J1Q9Y385 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms