Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM2AQ9Y2K7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM2AQ9Y2K7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms