Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms