Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD1BQ9UPS6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1BQ9UPS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms