Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA3Q9UL41 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA3Q9UL41 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms