Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PACSIN3Q9UKS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms