Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2IRD1Q9UHL9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms