Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPC1L1Q9UHC9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms