Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO40Q9UH90 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO40Q9UH90 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms