Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KDM5BQ9UGL1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KDM5BQ9UGL1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KDM5BQ9UGL1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms