Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms