Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NKX1-2Q9UD57 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms