Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MBD5Q9P267 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MBD5Q9P267 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms