Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms