Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CWC25Q9NXE8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CWC25Q9NXE8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms