Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms