Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L1Q9NU39 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms