Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBP3Q9NS15 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms