Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIT2Q9NQR4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms