Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms