Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms