Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAVER2Q9HCJ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAVER2Q9HCJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAVER2Q9HCJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAVER2Q9HCJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAVER2Q9HCJ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAVER2Q9HCJ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms