Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNRC6CQ9HCJ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms