Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP3Q9H4L4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms