Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF541Q9H0D2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF541Q9H0D2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms