Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLR1EQ9GZS1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLR1EQ9GZS1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms