Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL11BQ9C0K0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms