Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE41Q9C0J9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms