Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT23Q9C075 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT23Q9C075 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms