Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BCO2Q9BYV7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BCO2Q9BYV7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms