Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM55Q9BYV6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms