Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms