Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPATA9Q9BWV2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPATA9Q9BWV2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms