Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MXD3Q9BW11 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MXD3Q9BW11 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MXD3Q9BW11 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MXD3Q9BW11 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MXD3Q9BW11 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms