Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THUMPD2Q9BTF0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms